cloning pada e coli ( biokimia)

Cloning pada e. coli
Cloning in biology is the process of producing similar populations of genetically identical individuals that occurs in nature when organisms such as bacteria, insects or plants reproduce asexually. Cloning in biotechnology refers to processes used to create copies of DNA fragments (molecular cloning), cells (cell cloning), or organisms.
Molecular cloning refers to the process of making multiple molecules. Cloning is commonly used to amplify DNA fragments containing whole genes, but it can also be used to amplify any DNA sequence such as promoters, non-coding sequences and randomly fragmented DNA
Cloning of any DNA fragment essentially involves four steps
1. fragmentation - breaking apart a strand of DNA
2. ligation - gluing together pieces of DNA in a desired sequence
3. transfection - inserting the newly formed pieces of DNA into cells
4. screening/selection - selecting out the cells that were successfully transfected with the new DNA
Cloning a cell means to derive a population of cells from a single cell. In the case of unicellular organisms such as bacteria and yeast, this process is remarkably simple and essentially only requires the inoculation of the appropriate medium. However, in the case of cell cultures from multi-cellular organisms, cell cloning is an arduous task as these cells will not readily grow in standard media.
Organism cloning (also called reproductive cloning) refers to the procedure of creating a new multicellular organism, genetically identical to another. In essence this form of cloning is an asexual method of reproduction, where fertilization or inter-gamete contact does not take place.
http://en.wikipedia.org/wiki/Cloning"

Kloning dapat secara in vitro , dengan proses yang disebut reaksi berantai polimerase (PCR). Here, however, we shall examine how cloning is done in vivo . Namun, di sini kita akan mengkaji bagaimana kloning dilakukan in vivo .
Cloning in vivo can be done in Kloning in vivo dapat dilakukan
• unicellular microbes like E. uniseluler mikroba seperti E. coli coli
• unicellular eukaryotes like yeast and uniseluler eukariota seperti ragi dan
• in mammalian cells grown in tissue culture. dalam sel-sel mamalia ditumbuhkan dalam kultur jaringan.
In every case, the recombinant DNA must be taken up by the cell in a form in which it can be replicated and expressed. Dalam setiap kasus, DNA rekombinan harus diambil oleh sel dalam bentuk yang dapat direplikasi dan diekspresikan. This is achieved by incorporating the DNA in a vector . Hal ini dicapai dengan memasukkan DNA ke dalam vektor . A number of viruses (both bacterial and of mammalian cells) can serve as vectors. Sejumlah virus (baik bakteri dan sel mamalia) dapat berfungsi sebagai vektor. But here let us examine an example of cloning using E. Tapi di sini mari kita memeriksa contoh kloning menggunakan E. coli as the host and a plasmid as the vector. coli sebagai tuan rumah dan plasmid sebagai vektor.
Plasmids


Electron micrograph of an E. coli cell ruptured to release its DNA. The tangle is a portion of a single DNA molecule containing over 4.6 million base pairs encoding approximately 4,300 genes. The small circlets are plasmids. (Courtesy of Huntington Potter and David Dressler, Harvard Medical School.)
Plasmids are molecules of DNA that are found in bacteria separate from the bacterial chromosome.
They:
• are small (a few thousand base pairs)
• usually carry only one or a few genes
• are circular
• have a single origin of replication
Plasmids are replicated by the same machinery that replicates the bacterial chromosome. Some plasmids are copied at about the same rate as the chromosome, so a single cell is apt to have only a single copy of the plasmid. Other plasmids are copied at a high rate and a single cell may have 50 or more of them.
Genes on plasmids with high numbers of copies are usually expressed at high levels. In nature, these genes often encode proteins (e.g., enzymes) that protect the bacterium from one or more antibiotics.
Plasmids enter the bacterial cell with relative ease. This occurs in nature and may account for the rapid spread of antibiotic resistance in hospitals and elsewhere. Plasmids can be deliberately introduced into bacteria in the laboratory transforming the cell with the incoming genes.
An Example
(courtesy of David Miklos and Greg Freyer of the Cold Spring Harbor Laboratory, who used these plasmids as the basis of a laboratory introduction to recombinant DNA technology that every serious biology student — high school or college — should experience!)
pAMP
• 4539 base pairs
• a single replication origin
• a gene (ampr)conferring resistance to the antibiotic ampicillin (a relative of penicillin)
• a single occurrence of the sequence
5'GGATCC3'

that, as we saw above, is cut by the restriction enzyme BamHI
• a single occurrence of the sequence
5'AAGCTT3'

that is cut by the restriction enzyme HindIII
Treatment of pAMP with a mixture of BamHI and HindIII produces:
• a fragment of 3755 base pairs carrying both the ampr gene and the replication origin
• a fragment of 784 base pairs
• both fragments have sticky ends
pKAN
• 4207 base pairs
• a single replication origin
• a gene (kanr) conferring resistance to the antibiotic kanamycin.
• a single site cut by BamHI
• a single site cut by HindIII
Treatment of pKAN with a mixture of BamHI and HindIII produces:
• a fragment of 2332 base pairs
• a fragment of 1875 base pairs with the kanr gene (but no origin of replication)
• both fragments have sticky ends
These fragments can be visualized by subjecting the digestion mixtures to electrophoresis in an agarose gel. Because of its negatively-charged phosphate groups, DNA migrates toward the positive electrode (anode) when a direct current is applied. The smaller the fragment, the farther it migrates in the gel.
Ligation Possibilities
If you remove the two restriction enzymes and provide the conditions for DNA ligase to do its work, the pieces of these plasmids can rejoin (thanks to the complementarity of their sticky ends).
Mixing the pKAN and pAMP fragments provides several (at least 10) possibilities of rejoined molecules. Some of these will not produce functional plasmids (molecules with two or with no replication origin cannot function).

One interesting possibility is the joining of
• the 3755-bp pAMP fragment (with ampr and a replication origin) with the
• 1875-bp pKAN fragment (with kanr)
Sealed with DNA ligase, these molecules are functioning plasmids that are capable of conferring resistance to both ampicillin and kanamycin. They are molecules of recombinant DNA.
Because the replication origin, which enables the molecule to function as a plasmid, was contributed by pAMP, pAMP is called the vector.
Transforming E. coli
Treatment of E. coli with the mixture of religated molecules will produce some colonies that are able to grow in the presence of both ampicillin and kanamycin.
• A suspension of E. coli is treated with the mixture of religated DNA molecules.
• The suspension is spread on the surface of agar containing both ampicillin and kanamycin.
• The next day, a few cells — resistant to both antibiotics — will have grown into visible colonies containing billions of transformed cells.
• Each colony represents a clone of transformed cells.
However, E. coli can be simultaneously transformed by more than one plasmid, so we must demonstrate that the transformed cells have acquired the recombinant plasmid.
Electrophoresis of the DNA from doubly-resistant colonies (clones) tells the story.
• Plasmid DNA from cells that acquired their resistance from a recombinant plasmid only show only the 3755-bp and 1875-bp bands (Clone 1, lane 3).
• Clone 2 (Lane 4) was simultaneous transformed by religated pAMP and pKAN. (We cannot tell if it took up the recombinant molecule as well.)
• Clone 3 (Lane 5) was transformed by the recombinant molecule as well as by an intact pKAN.
Cloning other Genes
The recombinant vector described above could itself be a useful tool for cloning other genes. Let us assume that within its kanamycin resistance gene (kanr) there is a single occurrence of the sequence
5' GAATTC 3'
3' CTTAAG 5'
This is cut by the restriction enzyme EcoRI, producing sticky ends.
If we treat any other sample of DNA, e.g., from human cells, with EcoRI, fragments with the same sticky ends will be formed. Mixed with EcoRI-treated plasmid and DNA ligase, a small number of the human molecules will become incorporated into the plasmid which can then be used to transform E. coli.
But how to detect those clones of E. coli that have been transformed by a plasmid carrying a piece of human DNA?
The key is that the EcoRI site is within the kanr gene, so when a piece of human DNA is inserted there, the gene's function is destroyed.
All E. coli cells transformed by the vector, whether it carries human DNA or not, can grow in the presence of ampicillin. But E. coli cells transformed by a plasmid carrying human DNA will be unable to grow in the presence of kanamycin.
So,
• Spread a suspension of treated E. coli on agar containing ampicillin only
• grow overnight
• with a sterile toothpick transfer a small amount of each colony to an identified spot on agar containing kanamycin
• (do the same with another ampicillin plate)
• Incubate overnight
All those clones that continue to grow on ampicillin but fail to grow on kanamycin (here, clones 2, 5, and 8) have been transformed with a piece of human DNA.
Some recombinant DNA products being used in human therapy
Using procedures like this, many human genes have been cloned in E. coli or in yeast. This has made it possible — for the first time — to produce unlimited amounts of human proteins in vitro. Cultured cells (E. coli, yeast, mammalian cells) transformed with a human gene are being used to manufacture more than 100 products for human therapy. Some examples:
• insulin for diabetics
• factor VIII for males suffering from hemophilia A
• factor IX for hemophilia B
• human growth hormone (HGH)
• erythropoietin (EPO) for treating anemia
• several types of interferons
• several interleukins
• granulocyte-macrophage colony-stimulating factor (GM-CSF) for stimulating the bone marrow after a bone marrow transplant
• granulocyte colony-stimulating factor (G-CSF) for stimulating neutrophil production, e.g., after chemotherapy and for mobilizing hematopoietic stem cells from the bone marrow into the blood.
• tissue plasminogen activator (TPA) for dissolving blood clots
• adenosine deaminase (ADA) for treating some forms of severe combined immunodeficiency (SCID)
• parathyroid hormone
• several monoclonal antibodies
• hepatitis B surface antigen (HBsAg) to vaccinate against the hepatitis B virus
• C1 inhibitor (C1INH) used to treat hereditary angioedema
http://www.google.co.id/search?client=firefox-a&rls=org.mozilla%3Aen-US%3Aofficial&channel=s&hl=id&source=hp&q=cloning+E.+coli&meta=&btnG=Penelusuran+Google
Top 5 Alasan E. coli digunakan untuk Gene Cloning
By Theresa Phillips , About.com Guide Dengan Phillips Theresa , Panduan About.com
See More About:
• drug resistant microorganisms
• therapeutic cloning
• DNA sequencing
• genetically modified organisms
The microorganism Escherichia coli has a long history of use in the biotechnology industry and is still the microorganism of choice for most gene cloning experiments. Although E. coli is known to the general population for the infectious nature of one particular strain (0157:H7) few people are aware of how versatile and useful E. coli is to genetic research. There are several reasons E. Ada beberapa alasan E. coli became so widely used and is still a common host for recombinant DNA.
1. 1. Genetic Simplicity Genetik Kesederhanaan
Bacteria make useful tools for genetic research because of their relatively small genome size compared to eukaryotes. E. Bakteri membuat alat yang berguna untuk penelitian genetika karena ukurannya yang relatif kecil dibandingkan genom eukariota. E. coli cells only have about 4,400 genes whereas the human genome project has determined that humans contain approximately 30,000 genes. coli sel hanya memiliki sekitar 4.400 gen sedangkan proyek genom manusia telah menetapkan bahwa manusia mengandung sekitar 30.000 gen. Also, bacteria, including E. Selain itu, bakteri, termasuk E. coli , live their entire lifetime in a haploid state, with no second allele to mask the effects of mutations during protein engineering experiments.
Weaver, R. dan Hedrick, P. 1989. Genetika. Wm. C. Brown Publishers, Dubuque, IA, USA.
Madigan, M., Martinko, J. dan Parker, J. 2000. Brock Biologi Mikro-organisme, 9 ed. Prentice Hall, Upper Saddle River, NJ, USA
2. Growth Rate
Bacteria typically grow much faster than more complex organisms. E. coli grows rapidly at a rate of one generation per twenty minutes under typical growth conditions. This allows for preparation of log-phase (mid-way to maximum density) cultures overnight and genetic experimental results in mere hours instead of several days, months or years. Faster growth also means better production rates when cultures are used in scaled up fermentation processes.
3. Safety
E. coli is naturally found in the intestinal tracts of humans and animals where it helps provide nutrients (vitamins K and B12) to its host. There are many different strains of E. coli that may produce toxins or cause varying levels of infection if injested or allowed to invade other parts of the body. Despite the bad reputation of one particularly toxic strain (O157:H7), E. coli are generally relatively inocuous if handled with reasonable hygiene.
4. Conjugation and the Genome Sequence
The E. E. coli genome was the first to be completely sequenced. Genetic mapping in E. Pemetaan genetik dalam E. coli was made possible by the discovery of conjugation . E. coli is the most highly studied microorganism and an advanced knowledge of its protein expression mechanisms makes it simpler to use for experiments where expression of foreign proteins and selection of recombinants is essential.
5. Ability to Host Foreign DNA
Most gene cloning techniques were developed using this bacterium and are still more successful or effective in E. coli than in other microorganisms. E. coli is readily transformed with plasmids and other vectors , easily undergoes transduction , and preparation of competent cells (cells that will take up foreign DNA) is not complicated.Transformations with other microorganisms are often less successful. http://translate.google.co.id/translate?hl=id&sl=en&u=http://biotech.about.com/od/technicaltheory/tp/Ecoli.htm&ei=-dUATY76GIOvrAfM8NmRDw&sa=X&oi=translate&ct=result&resnum=1&ved=0CCMQ7gEwAA&prev=/search%3Fq%3Dcloning%2Be%2Bcoli%26hl%3Did%26client%3Dfirefox-a%26sa%3DG%26rls%3Dorg.mozilla:en-US:official%26channel%3Ds%26prmd%3Div









Cloning pada e. coli
Kloning dalam biologi adalah proses menghasilkan populasi serupa genetik individu identik yang terjadi di alam saat organisme seperti bakteri , serangga atau tanaman bereproduksi secara aseksual . Kloning dalam bioteknologi mengacu pada proses yang digunakan untuk membuat salinan DNA fragmen ( kloning molekuler ), sel (kloning sel), atau organisme.

kloning molekuler mengacu pada proses pembuatan beberapa molekul. Cloning umumnya digunakan untuk mengamplifikasi fragmen DNA yang mengandung seluruh gen , tetapi juga dapat digunakan untuk memperkuat setiap urutan DNA seperti promotor , non-coding sequences dan DNA secara acak terfragmentasi.
Kloning dari setiap fragmen DNA dasarnya melibatkan empat langkah
1. fragmentasi – pemutusan sebuah untai DNA
2. ligasi - perekatan bersama potongan-potongan DNA dalam urutan yang diinginkan
3. transfeksi - memasukkan potongan-potongan yang baru terbentuk DNA ke dalam sel
4. penyaringan / seleksi - memilih keluar sel yang berhasil transfected dengan DNA baru
Kloning sel sarana untuk memperoleh suatu populasi sel dari satu sel. Dalam kasus organisme uniseluler seperti bakteri dan ragi, proses ini sangat sederhana dan pada dasarnya hanya memerlukan inokulasi medium yang sesuai. Namun, dalam kasus budaya sel dari organisme multi-selular, kloning sel adalah tugas yang berat sebagai sel-sel ini tidak akan mudah tumbuh dalam media standar.
kloning Organisme (juga disebut kloning reproduksi) mengacu pada prosedur untuk menciptakan organisme multiselular baru, secara genetik identik dengan yang lain. Pada intinya ini bentuk kloning adalah sebuah metode aseksual reproduksi, di mana pembuahan atau kontak antar-gamet tidak terjadi.
Kloning dapat secara in vitro , dengan proses yang disebut reaksi berantai polimerase (PCR)
Namun, di sini kita akan mengkaji bagaimana kloning dilakukan in vivo

Kloning in vivo dapat dilakukan
• uniseluler mikroba seperti E. coli coli
• uniseluler eukariota seperti ragi dan
• dalam sel-sel mamalia ditumbuhkan dalam kultur jaringan.
Dalam setiap kasus, DNA rekombinan harus diambil oleh sel dalam bentuk yang dapat direplikasi dan diekspresikan.Hal ini dicapai dengan memasukkan DNA ke dalam vektor . Sejumlah virus (baik bakteri dan sel mamalia) dapat berfungsi sebagai vektor. Tapi di sini mari kita memeriksa contoh kloning menggunakan E. coli sebagai tuan rumah dan plasmid sebagai vektor.
Plasmid

mikrograf elektron dari sel E. coli pecah untuk melepaskan DNA-nya. Tangle adalah bagian dari sebuah molekul DNA tunggal yang berisi lebih dari 4,6 juta basis pengkodean pasang sekitar 4.300 gen. Para circlets kecil plasmid. (Courtesy of Potter Huntington dan Dressler David, Harvard Medical School.)

Plasmid adalah molekul DNA yang ditemukan pada bakteri terpisah dari kromosom bakteri.
Mereka:
• kecil (beberapa ribu pasang basa)
• biasanya membawa hanya satu atau beberapa gen
• lingkaran
• memiliki satu asal replikasi
Plasmid adalah direplikasi oleh mesin yang sama yang mereplikasi kromosom bakteri. Beberapa plasmid akan disalin pada tingkat yang sama dengan kromosom, sehingga sel tunggal cenderung hanya satu salinan plasmid. Plasmid lainnya disalin pada tingkat tinggi dan sebuah sel tunggal dapat memiliki 50 atau lebih dari gen.
Gen pada plasmid dengan salinan angka tinggi biasanya disajikan pada tingkat tinggi. Di alam, gen ini sering protein menyandi (misalnya, enzim) yang melindungi bakteri dari satu atau lebih antibiotik .
Plasmid masuk ke dalam sel bakteri dengan relatif mudah. Hal ini terjadi di alam dan dapat account untuk penyebaran cepat resistensi antibiotik di rumah sakit dan di tempat lain. Plasmid dapat sengaja diperkenalkan ke bakteri di laboratorium mengubah sel dengan gen yang masuk.

Kemungkinan ligasi
Jika Anda menghapus dua enzim restriksi dan memberikan kondisi untuk ligase DNA untuk melakukan tugasnya, potongan-potongan dari plasmid dapat bergabung kembali (berkat saling melengkapi ujung lengket mereka).
Mencampur pKAN dan fragmen pAMP menyediakan beberapa (minimal 10) kemungkinan bergabung kembali molekul. Some of these will not produce functional plasmids (molecules with two or with no replication origin cannot function). Beberapa tidak akan menghasilkan plasmid fungsional (molekul dengan dua atau tanpa asal replikasi tidak dapat berfungsi).

Salah satu kemungkinan menarik adalah bergabungnya
• fragmen-3755 (dengan r amp dan asal replikasi) dengan
• 1875-bp pKAN fragmen (dengan r kan)
Sealed dengan ligase DNA, molekul ini berfungsi plasmid yang mampu conferring perlawanan terhadap kedua ampisilin dan kanamisin. They are molecules of recombinant DNA . Mereka adalah molekul DNA rekombinan.
Because the replication origin, which enables the molecule to function as a plasmid , was contributed by pAMP, pAMP is called the vector . Karena asal replikasi, yang memungkinkan molekul berfungsi sebagai plasmid , disumbangkan oleh pAMP, pAMP disebut vektor .
Transformasi E. coli
Pengobatan E. coli dengan campuran molekul religated akan menghasilkan beberapa koloni yang mampu tumbuh di hadapan kedua ampisilin dan kanamisin.
• Skorsing E. coli diperlakukan dengan campuran molekul DNA religated.
• Suspensi tersebar pada permukaan agar-agar yang mengandung ampisilin dan kanamisin.
• . Keesokan harinya, beberapa sel - resisten terhadap kedua antibiotik - akan tumbuh menjadi koloni terlihat mengandung milyaran sel berubah.
• Setiap koloni merupakan klon sel berubah.
.Namun, E. coli dapat diubah secara bersamaan oleh lebih dari satu plasmid, jadi kita harus menunjukkan bahwa sel-sel berubah telah memperoleh plasmid rekombinan. Elektroforesis DNA dari koloni doubly-tahan (klon) menceritakan tentang ;
• Plasmid DNA dari sel-sel yang diperoleh perlawanan mereka dari plasmid rekombinan hanya menunjukkan hanya 3.755-dan-bp bp band 1875 (Clone 1, lajur 3).
• (Kami tidak dapat memberitahukan apakah ia mengambil molekul rekombinan juga.)
• Clone 3 (Lane 5) telah diubah oleh molekul rekombinan serta oleh pKAN utuh.
Kloning Gen lainnya
Vektor rekombinan yang dijelaskan di atas bisa sendiri menjadi alat yang berguna untuk kloning gen-gen lain. Let us assume that within its kanamycin resistance gene ( kan r ) Mari kita berasumsi bahwa di dalam gen resistensi kanamisin nya (kan r) ada kejadian tunggal urutan

3' CTTAAG 5' 3 'CTTAAG 5'
. Hal ini dipotong oleh enzim restriksi EcoRI , menghasilkan berakhir lengket.
Jika kita memperlakukan setiap sampel lainnya DNA, misalnya, dari sel-sel manusia, dengan EcoRI, fragmen dengan ujung lengket sama akan terbentukDicampur dengan plasmid EcoRI-diperlakukan dan ligase DNA, sejumlah kecil dari molekul manusia akan menjadi dimasukkan ke dalam plasmid yang kemudian dapat digunakan untuk mengubah E. coli.
Tapi bagaimana untuk mendeteksi klon E. coli yang telah ditransformasi oleh plasmid membawa sepotong DNA manusia?
Kuncinya adalah bahwa situs EcoRI berada dalam gen r kan, jadi ketika sepotong DNA manusia dimasukkan ada, gen fungsi ini hancur.

Semua sel E. coli diubah oleh vektor, apakah itu membawa DNA manusia atau tidak, dapat tumbuh di hadapan ampisilin.. Tapi sel E. coli berubah oleh plasmid yang membawa DNA manusia tidak akan bisa tumbuh di hadapan kanamycin.
Jadi,
• Spread suspensi E. coli diperlakukan hanya agar yang mengandung ampisilin
• tumbuh semalam
• dengan tusuk gigi steril transfer sejumlah kecil koloni masing-masing ke tempat yang diidentifikasi pada agar yang mengandung kanamisin
• (Melakukan hal yang sama dengan yang lain pelat ampisilin)
• Menetaskan semalam
Semua klon yang terus tumbuh pada ampisilin tetapi gagal tumbuh pada kanamisin (di sini, klon 2, 5, dan 8) telah berubah dengan sepotong DNA manusia.
http://biotech.about.com/gi/o.htm?zi=1/XJ&zTi=1&sdn=biotech&cdn=b2b&tm=23&f=00&su=p649.6.336.ip_&tt=3&bt=0&bts=0&zu=http%3A//translate.googleusercontent.com/translate_c%3Fhl%3Did%26sl%3Den%26u%3Dhttp%3A//users.rcn.com/jkimball.ma.ultranet/BiologyPages/R/RecombinantDNA.html%26prev%3D/search%253Fq%253Dcloning%252Be%252Bcoli%2526hl%253Did%2526client%253Dfirefox-a%2526sa%253DG%2526rls%253Dorg.mozilla%3Aen-US%3Aofficial%2526channel%253Ds%2526prmd%253Div%26rurl%3Dtranslate.google.co.id%26usg%3DALkJrhhPlYzUr0t7xdqyKMw1smYIKmDvWA
Top 5 Alasan E. coli digunakan untuk Gene Cloning
Dengan Phillips Theresa , Panduan About.com
Lihat Lebih Tentang:
• resistan terhadap obat mikroorganisme
• terapeutik kloning
• DNA sequencing
• rekayasa genetika organisme
Escherichia coli mikroorganisme memiliki sejarah panjang digunakan dalam industri bioteknologi dan masih merupakan mikroorganisme pilihan untuk kloning gen sebagian besar percobaan. Meskipun E. coli dikenal masyarakat umum untuk sifat menular dari satu strain tertentu (0157: H7) sedikit orang yang menyadari bagaimana serbaguna dan berguna E. coli adalah untuk penelitian genetik. Ada beberapa alasan E. coli menjadi begitu banyak digunakan dan masih merupakan host umum untuk DNA rekombinan.
1. Genetik Kesederhanaan
Bakteri membuat alat yang berguna untuk penelitian genetika karena ukurannya yang relatif kecil dibandingkan genom eukariota. E. coli sel hanya memiliki sekitar 4.400 gen sedangkan proyek genom manusia telah menetapkan bahwa manusia mengandung sekitar 30.000 gen. Selain itu, bakteri, termasuk E. coli, tinggal seumur hidup mereka dalam keadaan haploid, tanpa alel kedua untuk menutupi efek mutasi pada rekayasa protein percobaan.
sumber:
Weaver, R. dan Hedrick, P. 1989. Genetika. Wm. C. Brown Publishers, Dubuque, IA, USA.
Madigan, M., Martinko, J. dan Parker, J. 2000. Brock Biologi Mikro-organisme, 9 ed. Prentice Hall, Upper Saddle River, NJ, USA.
2. Laju Pertumbuhan
Bakteri biasanya tumbuh lebih cepat dibandingkan organisme yang lebih kompleks. E. coli tumbuh pesat pada tingkat satu generasi per dua puluh menit dalam kondisi pertumbuhan khas. Hal ini memungkinkan untuk persiapan log-fase (pertengahan-cara untuk kepadatan maksimum) budaya semalam dan hasil eksperimen genetik jam hanya beberapa bulan bukan hari, atau tahun. pertumbuhan yang lebih cepat juga berarti tingkat produksi lebih baik bila budaya digunakan dalam ditingkatkan fermentasi proses.
3. Keselamatan
E. coli secara alami ditemukan di saluran usus manusia dan hewan di mana ia membantu memberikan nutrisi (vitamin K dan B12) ke host-nya. Ada berbagai jenis banyak dari E. coli yang dapat menghasilkan racun atau menyebabkan berbagai tingkat infeksi jika injested atau diizinkan untuk menyerang bagian lain dari tubuh. Meskipun reputasi buruk satu terutama strain beracun (O157: H7), E. coli umumnya relatif inocuous jika ditangani dengan kebersihan yang wajar.
4. Konjugasi dan Genome Sequence
E. coli genom adalah yang pertama harus benar-benar diurutkan. Pemetaan genetik dalam E. coli dimungkinkan oleh penemuan konjugasi . E. coli adalah mikroorganisme yang paling sangat dipelajari dan pengetahuan yang canggih mekanisme ekspresi protein yang membuatnya mudah untuk digunakan untuk percobaan di mana ekspresi protein asing dan seleksi rekombinan sangat penting.
5. Kemampuan untuk Host DNA Asing
kloning gen teknik Sebagian besar dikembangkan dengan menggunakan bakteri ini dan masih lebih sukses atau efektif dalam E. coli daripada di mikroorganisme lainnya. E. coli siap berubah dengan plasmid dan vektor , mudah mengalami transduksi , dan persiapan sel kompeten (sel-sel yang akan mengambil DNA asing) tidak rumit. Transformasi dengan mikroorganisme lainnya seringkali kurang berhasil.
http://biotech.about.com/od/technicaltheory/tp/Ecoli.htm&ei=MksHTe6TOMXsrAf8gN2nDg&sa=X&oi=translate&ct=result&resnum=1&ved=0CB4Q7gEwAA&prev=/search%3Fq%3Dkloning%2Bpada%2Be%2Bcoli%26hl%3Did%26client%3Dfirefox-a%26hs%3DhW8%26rls%3Dorg.mozilla:en-US:official%26prmd%3Div